No homem:
O alimento introduzido na boca passa pela primeira transformação, sendo mecânica ou química. Na boca, o alimento é mastigado, insalivado e parcialmente digerido. A mastigação, efetuada pelos dentes, tem a função de reduzir o alimento sólido em pequenas partes para facilitar as fases sucessivas. Com a insalivação as pequenas partes ficam amolecidas pela saliva e se transformam em bolo alimentar, o qual passa pela primeira reação química com a amilase, secretada na saliva humana (e de alguns, mas não em todos os outros mamíferos) que transforma as grandes moléculas de amido em moléculas menores.Após passar pela primeira transformação, na boca, o bolo é enviado para o estômago pelos movimentos coordenados e sincronizados da língua, da faringe e do esôfago através da deglutição. No estômago, o bolo alimentar permanece por um período que, a depender da natureza e da quantidade do alimento, pode chegar a mais de 6 horas. Ali é misturado pelos movimentos gástricos e passa por importantes transformações químicas que é a digestão das proteínas pela a ação da pepsina, uma enzima secretada pelas glândulas dos vertebrados, que age em ambiente fortemente ácido causado pelo o ácido clorídrico que, também, é secretado pelo estômago; a pepsina só é ativada na presença do ácido clorídrico para a hidrólise de proteínas em polipeptídeos e alguns aminoácidos livres.
Os movimentos peristálticos misturam o alimento no estômago, favorecendo o contato com as enzimas digestivas. No caso dos invertebrados, as enzimas são diferentes, mas a ação delas é semelhante à da pepsina dos vertebrados. O produto da digestão no estômago é o quimo que contém material protéico parcialmente digerido, carboidrato, em parte, e lipídio praticamente sem modificações da digestão gástrica. O quimo em breve intervalo de tempo atravessa para a região pilórica e na primeira parte do intestino delgado, o duodeno, os processos digestivos se completam e os principais mecanismos de absorção acontecem.A decomposição dos carboidratos, das proteínas (ligações peptídicas adjacentes a um aminoácido básico) e das gorduras, é completada, quase totalmente, no intestino delgado, graças à intervenção das enzimas tripsina e lipase, dos sucos digestivos produzidos pelo intestino, pâncreas e fígado. A ação digestiva reduz as estruturas elementares absorvíveis através da mucosa intestinal, o bolo alimentar que é, ainda, mais decomposto se transforma em quilo. Ao longo do intestino delgado, os produtos de digestão são absorvidos através das vilosidades intestinais, a exemplo das substâncias protéicas que são os aminoácidos, os quais atingem a corrente circulatória e sucessivamente também os músculos. As gorduras são absorvidas sob a forma de ácidos graxos e de complexos hidrossolúveis.
Depois da absorção, a massa alimentar, que é denominada quilo, através dos movimentos peristálticos do intestino delgado, segue para o intestino grosso e o que resta do quilo percorre todo o intestino grosso transformando-se, gradualmente, em fezes, que, recolhidas na ampola retal, são eliminadas com a defecação. O material alimentar que não foi submetido aos processos enzimáticos na passagem pelo o estômago e intestino nos monogástricos como o cavalo, o porco e o coelho, um sucessivo processo do tipo fermentativo é realizado no intestino grosso.
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